停用一夜的水龙头及附近水管中的自来水是静止的，水中的残留微生物会大量繁殖，其中可能就有“军团菌”。1976年，美国一群退伍军人在费城一家旅馆中举行年会。会后一个月，与会者中221人得了一种“怪病”，34人相继死亡。研究证实，其元凶是存在于水龙头和水槽水样中的一种致微生物—军团菌。医学界后来把这种病名为“军团菌”，患病者若不及时治疗，死亡率可高达25%—30%。最近20年来，军团菌在许多国家爆发、流行，已经引起了医学界的广泛重视。

      此外，经过一夜停止不动的水，会与金属管壁及水龙头金属腔室产生水化反应，形成金属污染水，这就是早夺第一次放水时往往会见到一些反常形象，比如水色发黄、发白、或者发浑的原因。另外，我们的水源大都为地表水，受洗涤剂等有机物污染较大。一些有机化合物会和通入水中的消毒剂—氯气反应成卤烃化合物，如三氯甲烷，这类物质有潜在的致癌性。